北京大學深圳醫(yī)院原名“深圳市中心醫(yī)院”，是深圳市政府投資4.5億元人民幣建成，并于1999年8月開業(yè)的現(xiàn)代化綜合性醫(yī)院。北京大學深圳醫(yī)院目前開放病床930張，2008年門診量210萬人次，出院病人3.6萬人次，收入9.3億元。近期，深圳市政府投資近7億元，新建外科樓和科教樓。醫(yī)院總建筑面積將達22.3萬m2，病床1200張。2009年9月26日，科教樓順利竣工并舉行移交儀式。2001年9月，深圳市與北京大學簽署協(xié)議，醫(yī)院更名“北京大學深圳醫(yī)院”和“北京大學深圳臨床醫(yī)學院”，納入北京大學醫(yī)院管理體系。醫(yī)院正式更名、掛牌。經(jīng)過10年苦心經(jīng)營，目前北京大學深圳醫(yī)院的總資產、凈資產是開業(yè)時的3倍，現(xiàn)代化醫(yī)療設備價值超過4億元。引進各級、各類人才1200多名，其中副主任醫(yī)師以上471名，博士學位117名，碩士學位390多名，有海外留學經(jīng)歷81名，北京大學的及畢業(yè)生84名。北京大學深圳醫(yī)院開設臨床醫(yī)技科室52個，其中重點學科1個，省級重點實驗室1個，市級重點專科(實驗室)5個，院級重點學科4個。經(jīng)國家人事部批準，醫(yī)院建立深圳市衛(wèi)生系統(tǒng)首家博士后科研工作站。建立北京大學博士點3個，碩士點14個。10年來，醫(yī)院緊抓科學管理和改革創(chuàng)新兩條主線，在辦醫(yī)理念、院-校合作、健康產業(yè)、支持保障、領導體制、選人用人、制度建設、醫(yī)院文化等方面取得一定的創(chuàng)新和突破。